Hovedforskjellen mellom RP HPLC og HIC er at RP HPLC bruker en mer polær mobil fase og en mindre polær stasjonær fase. Mens HIC bruker en hydrofob stasjonær fase som gjør at de hydrofobe molekylene kan feste seg til den.
Kromatografi er en analytisk teknikk som hjelper til med å skille en blanding i komponentene. Først må vi løse opp prøven som skal skilles ut i en løsning. Denne løsningen-stoffblandingen kalles den mobile fasen. Deretter føres mobilfasen gjennom et annet materiale som kalles den stasjonære fasen. Den stasjonære fasen bestemmer separasjonen av komponentene. Skillet skjer på grunn av partisjonering av materiale mellom den mobile fasen og den stasjonære fasen.