Hovedforskjellen mellom oligopeptid og polypeptid er at oligopeptider inneholder få aminosyrerester, mens polypeptider inneholder et stort antall aminosyrerester.
Begrepene oligopeptider og polypeptider kommer under kategorien proteiner. Peptider er korte kjeder av aminosyrer. Aminosyrer binder seg til hverandre gjennom peptidbindinger. Derfor kan vi kategorisere disse peptidene etter antall aminosyrer som er tilstede i disse peptidene. F.eks. Dipeptider, tripeptider, tetrapeptider, oligopeptider og polypeptider.