Hovedforskjellen mellom agarbrønn og skivediffusjonsmetode er at i agarbrønndiffusjonsmetoden fylles ekstraktløsningen i et hull eller en brønn som er opprettet på agarmediet, mens i filterdiffusjonsmetoden med agar er en filterpapirskive som inneholder testløsningen plassert på agaroverflaten.
Mikroorganismer er agensene for mange sykdommer. Det er forskjellige antimikrobielle midler som dreper mikroorganismer og hemmer eller stopper deres vekst. Ulike screening- og evalueringsmetoder er tilgjengelige for påvisning av antimikrobiell aktivitet. Blant dem er agarbrønndiffusjonsmetoder og agardiskdiffusjonsmetoder ofte brukt metoder i in vitro-analyse, som er agardiffusjonsmetoder. Disse metodene er mye brukt siden de ikke krever spesifisert utstyr og ytterligere evaluering for reproduserbarhet og standardisering. Begge metodene avhenger av diffusjonen av det antimikrobielle middel gjennom agarmediet.
