Hovedforskjellen mellom Ubiquinones og Cytochromes er at Ubiquinones (CoQ) ikke er proteiner mens Cytochromes er proteiner.
Elektron transportkjede er den siste fasen av aerob respirasjon. Derfor forekommer det i den indre membranen av mitokondrier. Videre består den av elektronbærere som letter produksjonen av en protongradient over membranen. Annet enn NAD og flavoproteiner, er Ubiquinones og Cytochromes to typer elektronbærere involvert i elektrontransportkjeden. Ubiquinoner er ikke-protein lipidløselige, hydrofobe organiske molekyler, mens cytokromer er jernholdige proteiner.
