Hovedforskjellen mellom kloningsvektor og ekspresjonsvektor er at kloningsvektor bærer et fremmed DNA-fragment inn i vertscellen mens ekspresjonsvektor letter ekspresjon av gener i proteiner.
Vektor er et viktig begrep i molekylærbiologi. I rekombinant DNA-teknologi er hovedrollen til en vektor å tilveiebringe en transportmåte til en nyttig DNA-fraksjon som skal settes inn i en vertscelle. Videre er det et DNA-molekyl som brukes til å bære et fremmed DNA-fragment kunstig inn i en vertscelle som skal uttrykkes eller replikeres. Mest brukte vektorer er plasmider, virusvektorer, kosmider og kunstige kromosomer. Kloningsvektor og ekspresjonsvektor er to typer vektorer klassifisert basert på deres applikasjoner.