Hovedforskjellen mellom endoparasitter og ektoparasitter er at endoparasittene er parasittiske organismer som lever inne i vertsorganismen mens ektoparasitter er parasittiske organismer som lever utenfor verten, hovedsakelig på huden.
En parasitt er en organisme som lever på eller i en annen organisme kjent som verten. Parasitten får næringsstoffer fra verten. Parasitisme er forholdet som eksisterer mellom vert og parasitt. Parasitter er alltid avhengige av en vert, og de kan ikke leve uten verten. Dette forholdet er skadelig for verten, men det er gunstig for parasitten. Dette kan føre til alvorlige sykdommer hos vertene. Noen ganger kan parasitter til og med drepe verten. Mange parasitter har komplekse livssykluser som trenger flere verter for vekst og reproduksjon. For det har de skaffet seg mange unike tilpasninger som kan endre oppførselen til verten og gjøre dem mer sårbare for deres rovdyr. Denne prosessen muliggjør overføring av parasittstadier fra en vert til en annen. Avhengig av livsmiljøet til parasitter,de kan klassifiseres som endoparasitter og ektoparasitter.
