Hovedforskjellen mellom mesenkymale og hematopoietiske stamceller er at mesenkymale stamceller kan skille seg ut i nevroner, bein, brusk, muskel og fettvevsceller mens hematopoietiske stamceller kan skille seg ut i alle typer blodceller i kroppen vår.
Stamceller er udifferensierte eller uspesialiserte celler som er tilstede i kroppen vår. De er i stand til å dele og gi samme type stamceller eller differensiere i spesialiserte celler i vev som har spesifiserte funksjoner. På grunn av disse bemerkelsesverdige evnene til stamceller, brukes de til å reparere og regenerere skadet vev. Mesenkymale stamceller og hematopoietiske stamceller er to typer stamceller som er ekstremt viktige. Mesenkymale stamceller (ikke-hematopoietiske stamceller) er multipotente stamceller som kan generere bein, brusk og fettceller. På den annen side kan hematopoietiske stamceller danne alle typer blodceller i kroppen. Videre er begge disse stamcelletyper tilstede i benmargen.
