Hovedforskjellen mellom ledningsblod og benmargsstamceller er at stamcellene i ledningsblod er hematopoietiske celler som er tilstede i navlestrengen til den nyfødte etter fødselen, mens beinmargstamcellene er stamcellene som er tilstede i benmargen vev av individer.
Stamcelletransplantasjon er en vanlig terapeutisk prosedyre der en pasient får en dose bloddannende (stam) celler for å erstatte sine egne ødelagte celler med sykdom eller ved andre terapeutiske prosedyrer. Både stamceller i navlestrengsblod og stamceller i beinmarg har terapeutiske formål (transplantasjoner). Derfor er en vanlig bruk av disse stamcellene å erstatte de usunne cellene med en sunn. Klinisk er de vanligste kildene til sunne celler navlestrengsceller og benmargsceller.