Hovedforskjellen mellom nitrogensyklus og karbonsyklus er at nitrogensyklusen beskriver omdannelsen av nitrogen til flere kjemiske former og sirkulasjonen mellom atmosfæren, terrestriske og marine økosystemer, mens karbonsyklusen beskriver bevegelsen av karbon og dens flere kjemiske former mellom atmosfære, hav, biosfære og geosfære.
I et økosystem er biokjemiske sykluser viktige for å opprettholde den naturlige balansen. Derfor kan vi for mange elementer i et økosystem tegne en syklus som oppsummerer bevegelsen til elementet gjennom de forskjellige komponentene i økosystemet. I syklusen blir elementer omdannet til komplekse molekyler og senere nedbrutt i nedbrytning til enklere molekyler. Alle sykluser har et større reservoarbasseng, som vanligvis er abiotisk. Nitrogen syklus, karbon syklus, fosfor syklus og hydrologiske sykluser er noen av de viktige biokjemiske syklusene i naturen. Derfor er det viktig å forstå stoffets sykling og opprettholde effektiv sykling for å redde miljøet fra forurensning.