Hovedforskjellen mellom hydrofobe og hydrofile aminosyrer er at de hydrofobe aminosyrene er ikke-polare, mens de hydrofile aminosyrene er polare.
Aminosyrer er byggesteinene til proteiner. Et protein er et gigantisk polymermolekyl som er en essensiell komponent i alle levende organismer. Videre er aminosyrer hovedsakelig i to typer som essensielle og ikke-essensielle aminosyrer. Videre kan vi kategorisere dem som hydrofile og hydrofobe aminosyrer, avhengig av deres fysisk-kjemiske natur. De er forskjellige fra hverandre, hovedsakelig basert på polariteten.
