Hovedforskjellen mellom glukogene og ketogene aminosyrer er at de glukogene aminosyrene produserer pyruvat eller andre glukoseforløpere under katabolismen mens ketogene aminosyrer produserer acetyl CoA og acetoacetyl CoA under katabolismen.
Aminosyrer er de grunnleggende molekylene, som utgjør den kjemiske strukturen til proteiner og polypeptider. Selv om det er forskjellige klassifikasjoner for aminosyrer, kan vi klassifisere dem som glukogene og ketogene aminosyrer, avhengig av mellomproduktene de danner under katabolismen. Som nevnt ovenfor, gir sluttproduktet av katabolismen av aminosyrer to typer mellomprodukter; enten pyruvat (eller til andre glukose-forløpere) eller acetyl CoA og acetoacetyl CoA.
