Hovedforskjellen mellom CRP og homocystein er at C-reaktivt protein (CRP) er et pentamerisk protein mens homocystein er en ikke-proteinogen alfa-aminosyre.
Betennelse er en kompleks biologisk respons utviklet mot forskjellige skadelige stimuli som patogener, skadede celler i kroppen eller irriterende stoffer. Det involverer immunceller, molekylære mediatorer og blodkar. Videre indikerer forskjellige markører mulige inflammatoriske tilstander. Derfor blir disse markørene brukt på kliniske nivåer for å identifisere forskjellige sykdomstilstander relatert til betennelse. C reaktivt protein (CRP) og homocystein er to slike markører.