Hovedforskjellen mellom troponin I og troponin T er at troponin I binder med aktin mens troponin T binder med tropomyosin under muskelsammentrekninger.
Troponiner er viktige proteinmolekyler som involverer muskelsammentrekning. Studier på troponin øker mye på grunn av dets viktigste betydning som hjertemarkør ved iskemiske hjertesykdommer. I menneskelig fysiologi er det tre typer troponiner. De tre separate gener koder for disse tre typene troponiner; Troponin C, Troponin T og Troponin I. Troponin I og Troponin T brukes som hjertemarkører i prognosene. Derfor binder Troponin I seg til aktinfilamentene under muskelsammentrekninger for å holde aktin-tropomyosinkomplekset på plass. På den annen side binder Troponin T seg til tropomyosin under muskelsammentrekninger. Troponin T hjelper tropomyosin til å hvile på aktin. Derfor er nøkkelforskjellen mellom Troponin I og Troponin T substratet som de binder seg til under muskelsammentrekninger.