Hovedforskjellen mellom cykloheksan og cykloheksen er at cykloheksan er et mettet hydrokarbon, mens cykloheksen er et umettet hydrokarbon.
Det finnes forskjellige typer organiske forbindelser laget ved å forbinde forskjellige elementer med karbonatomer. Sykloheksan og cykloheksen er hydrokarboner som bare består av karbon og hydrogenatomer. Hydrokarboner er i to former som aromatiske og alifatiske hydrokarboner. Videre kan vi kategorisere dem som mettede (alkaner) og umettede (alkener og alkyner) hydrokarboner. Alle bindinger mellom karbonatomer og hydrogener er enkeltbindinger i mettede hydrokarboner mens det er dobbelt- eller trippelbindinger mellom karbonatomene i umettede former.
