Hovedforskjellen mellom Caiman og Alligator er hvor de bor. Kaaimaner bor i Sør- og Mellom-Amerika mens Alligatorer bor i Sørøst-USA og Øst-Kina. De skiller seg også i sine underfamilier. Caiman tilhører underfamilien caimaninae mens alligator tilhører underfamilien alligatorinae.
Caiman og Alligator er to krokodiller som dyr. De tilhører reptildyrgruppen. Imidlertid skiller de seg fra krokodiller fra flere egenskaper. Begge dyrene er kaldblodige og lever i varme klimaer. De er semi-akvatiske og rovdyr. De lever i ferskvannsmiljøer, og er medlemmer av familien Alligatoridae. Imidlertid tilhører kaiman underfamilien caimaninae og alligator tilhører underfamilien alligatorinae.