Hovedforskjellen mellom Matlab og C-språk er at Matlab er et interaktivt databehandlingsmiljø, mens C-språk er et høyt nivå generelt programmeringsspråk. Videre blir Matlab mest brukt til vitenskap og ingeniøroppgaver og er en betalt programvare mens C-språket er generelt formål og er åpen kildekode.
Matlab er et miljø som hjelper til med å utføre matematiske beregninger som å løse differensiallikninger, beregne integrasjon, løse polynomer etc. Det gir forskjellige kommandoer for å utføre transformasjoner som Fourier, Laplace, Inverse Laplace og å lage forskjellige plott. På den annen side er C et høyt nivå generelt programmeringsspråk. Den brukes til å utvikle innebygde systemer, databaser, operativsystemer, kompilatorer og nettverksdrivere.