Transposon vs Retrotransposon
Transposoner og retrotransposoner er genetiske komponenter i DNA, og det er store forskjeller mellom dem. Den prosentvise tilstedeværelsen av disse genetiske materialene varierer mellom arter, og deres funksjoner bestemmer skjebnen til organismen med mutasjoner og andre fenotypisk viktige endringer. Transposoner og retrotransposoner er gener eller samlinger av visse gener som ligger i DNA-strengene, og endringer av deres plasseringer har vært hovedårsakene til disse konsekvensene. Imidlertid har denne artikkelen til hensikt å diskutere funksjonene til disse genene kort og presenterer en sammenligning mellom transposoner og retrotransposoner.
Hva er Transposon?
Transposoner er interessante fragmenter eller segmenter av DNA med evnen til å endre plasseringen av DNA-strengen i form av klippe og lime-mekanisme. På grunn av transposons mobilitet, er disse kjent som hoppegener. Transposons er av to hovedtyper kjent som klasse I Transposons og Class II Transposons. Vanligvis blir klasse II-typen referert til som transposons og klasse I-type referert til som retrotransposons. Prosessene for skjæring og liming av mobile DNA-segmenter reguleres av enzymtransposasen. Enzymet binder seg til begge ender av transposonet og kutter fosfodiesterbindinger av DNA-strengen, isolerer transposonet, flytter det til målstedet og binder på det nye stedet. Denne prosessen er imidlertid interessant å forstå,da noen transposoner bare kan bevege seg til bestemte steder bare på grunn av inkompatibiliteten til basesekvenser med målstedet. Gener med den ene enden av en enkelt streng har samme basesekvens med den andre enden av den andre enkeltstrengen er transposoner med klebrige kanter, fordi de kan binde seg til stedene til mål-DNA-strengen med samme basesekvens som i de klebrige endene. Imidlertid kan denne mobiliteten til gener forårsake endringer i genotypen så vel som i fenotypen til organismen. Forskere oppfant om transposons og genetisk modifisert mat og organismer i henhold til foretrukne tilpasninger ble deretter gjort tilgjengelig. Svært produktive landbruksavlinger, antibiotika med medisinske egenskaper,husdyr var noen av de fordelaktig utviklede produktene etter oppfinnelsen av transposons av Barbara McClintock på 1940-tallet.
Hva er Retrotransposon?
Retrotransposoner er klasse I-transposoner, og disse beveger seg gjennom genomet gjennom mekanismen for kopiering og liming. Mekanismen for mobiliteten til retrotransposoner involverer få hovedtrinn som kopiering av gensegmentet av DNA-strengen til RNA, overføring av kopien av RNA til målstedet, transkripsjon av RNA-sekvensen tilbake til DNA ved bruk av omvendt transkriptase og innsetting av genet inn i den nye plasseringen av DNA-strengen av genomet. De to endene av disse retrotransposoner har vanligvis lange terminale gjentakelser med ca. 1000 basepar, og de brukes som identifikasjonsegenskaper for disse genene. Disse genene amplifiseres lett inne i genomet, og prosentandelen av retrotransposoner i det menneskelige genomet er omtrent 50%. Disse kan være ganske farlige da det forårsakende viruset mot AIDS, HIV,og T-celle leukemivirus har retrotransposoner i deres RNA-genomer. Faktisk kan disse virusene binde retrotransposonene til et hvilket som helst sted i de humane DNA-strengene ved bruk av revers transkriptase og integrase. Integraseenzymet fungerer på samme måte som transposase i klasse II-transposoner.
Hva er forskjellen mellom Transposon og Retrotransposon?
• Transposoner er hoppende gener i klasse II mens retrotransposoner faller i kategorien klasse I.
• Transposons fungerer med transposaseenzymet mens retrotransposons fungerer med bruk av to hovedenzymer kjent som revers transkriptase og integrase.
• Terminalendene er mye lengre i retrotransposoner enn i transposons.
• Transposoner kuttes fra opprinnelsen og limes inn på målet; omvendt, retrotransposoner blir kopiert fra opprinnelsen til RNA og transkribert på målet.
• Flyttingen av retrotransposoner involverer RNA, men ikke i transposoner.
