Hovedforskjellen mellom archenteron og blastocoel er at archenteron er den primære tarmen som dannes under gastrulering i den utviklende zygoten, som senere utvikler seg til fordøyelsesslangen, mens blastocoel er et indre væskefylt eller eggeplommefylt hulrom i blastulaen som dannes under sprengningen.
Befruktning er hendelsen med seksuell reproduksjon som danner en diploid zygote. Zygoten blir til slutt et embryo. Embryoet gjennomgår mitotiske divisjoner og celledifferensiering, noe som gjør et flercellet embryo. Morula er en tidlig fase av fosteret, som inneholder 16 celler. Morula blir blastula ved den syvende spaltingen. Blastula inneholder 128 celler. Det er en hul kule av celler som omgir et indre væskefylt hulrom. Og dette væskefylte hulrommet til blastula er kjent som blastocoel. Blastula brettes innover og forstørres for å lage gastrula, som er en flerlagsstruktur som inneholder primære kimlag. Archenteron er den primære tarmen i gastrulaen. Archenteron utvikler seg til fordøyelsesslangen senere.
