Nøkkelforskjell - RNASE A vs RNASE H
Ribonukleasene er nukleaser som spesifikt nedbryter RNA til mindre enheter. De kan deles inn i to kategorier; endoribonukleaser og exoribonukleaser. Endoribonuklease er en endonuklease som enten kan bryte ned enkeltstrenget eller dobbeltstrenget RNA. Den spalter fosfodiesterbindinger i en RNA-polynukleotidkjede. Eksemplene er RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P og RNase H. Exoribonuklease er en eksonuklease som nedbryter RNA ved å fjerne terminale nukleotider fra enten 5'enden eller 3'enden av RNA-molekylet. Eksemplene er RNase R, RNase II, RNase D og RNase PH. Hovedforskjellen mellom RNASE A og RNASE H er at RNase A er en bukspyttkjertel-ribonuklease som spesifikt nedbryter enkeltstrenget RNA til mindre komponenter mens RNase H er et ikke-spesifikt enzym som spalter RNA i RNA-DNA-hybrid i mindre enheter via den hydrolytiske mekanismen.
INNHOLD
1. Oversikt og
nøkkelforskjell 2. Hva er RNASE A
3. Hva er RNASE H
4. Likheter mellom RNASE A og RNASE H
5. Sammenligning side om side - RNASE A vs RNASE H i tabellform
6. Sammendrag
Hva er RNASE A?
RNase A er en bukspyttkjertel-ribonuklease som spesifikt spalter de uparrede cytosin- og uracilrester i 3'-enden av enkeltstrenget RNA. RNase H fungerer ved en høyere saltkonsentrasjon (0,3 M eller høyere NaCl-konsentrasjon). Den hydrolytiske reaksjonen er to trinn. Det danner et 3 'fosforyleret produkt via 2', 3 'syklisk monofosfat mellomprodukt. Selv om det er spesifikt for enkeltstrenget RNA ved høyere saltkonsentrasjon, kan det også nedbryte dobbeltstrenget RNA og RNA i RNA-DNA-hybrid ved lavere NaCl-konsentrasjon (lavere enn 0,3 M NaCl).
Bruce Merrifield syntetiserte først dette enzymet. RNase A er et veldig populært enzym i molekylær forskning. Bovin bukspyttkjertel RNase A er et eksempel på RNase A. Og det er et av de hardeste enzymene som brukes i laboratoriet. Dette enzymet trenger ikke en kofaktor for aktiviteten. Det er et sterkt termostabilt enzym. RNase A er det første enzymet og det tredje proteinet som en riktig aminosyresekvens ble påvist. Dette enzymet er veldig lite med 124 aminosyrer og en molekylvekt på 12600 da. Og den har fire histidinrester (His 12 og His 119 som involverer en katalytisk reaksjon).
Figur 01: RNase A
RNase A kan isoleres ved å koke en rå prøve. Ved koking nedbryter alle andre enzymer gjenværende RNase A. RNase A er et utrolig stabilt enzym. Dette enzymet hemmer med ribonukleaseinhibitorprotein, tungmetall og uridin-vanadatkomplekser.
Hva er RNase H?
RNase H er et uspesifikt ribonukleaseenzym som kan nedbryte RNA i RNA-DNA-hybrid via hydrolytisk reaksjon. RNase H spalter 3'- OP-bindingen av RNA i en RNA-DNA-hybrid. Til slutt produserer den 3'OH og 5 'fosfatavsluttede produkter. I DNA-replikering spiller den en sentral rolle ved å fjerne RNA-primer etter at nye DNA-tråder er dannet. Under laboratorieforhold nedbryter det spesifikt RNA i RNA-DNA-hybrid, men ikke DNA og uhybridisert RNA. Og dette enzymet brukes vanligvis til å ødelegge RNA-malen etter at den første komplementære DNA-strengen er dannet under cDNA-syntese.
Figur 02: RNase H
RNase H bruker også i nukleasebeskyttelsesanalyser. Det kan også innlemmes i fjerning av poly A-hale fra mRNA. RNase H har evnen til å ødelegge det ikke-kodende RNA i og utenfor cellen. Metallionene kreves som medfaktorer for denne proteinaktiviteten. En chelator (EDTA) kan brukes til å hemme RNase H-enzymet.
Hva er likhetene mellom RNASE A og RNASE H?
- Begge har protein i naturen.
- Begge er endoribonuklease
- Begge kan nedbryte RNA.
- Begge utfører hydrolytiske reaksjoner.
- Molekylære laboratorier bruker begge disse.
Hva er forskjellen mellom RNASE A og RNASE H?
Diff Article Midt før tabell
RNASE A vs RNASE H |
|
| RNase A er en bukspyttkjertel-ribonuklease som spesifikt spalter 3'-enden av ikke-paret cytosin- og uracilrester av enkeltstrenget RNA ved høyere saltkonsentrasjon. | RNase H er et uspesifikt ribonukleaseenzym som kan nedbryte RNA i RNA-DNA-hybrid via hydrolytisk reaksjon. |
| Arten av RNA-spalting | |
| RNase A spalter spesifikt enkeltstrenget RNA ved høyere saltkonsentrasjon. | RNase H spalter RNA i RNA-DNA-hybrid. |
| Behov for medfaktorer for aktivitet | |
| RNase A trenger ikke kofaktorer for sin aktivitet. | RNase H trenger metallioner som medfaktorer for sin aktivitet. |
| Hemmere av proteinaktivitet | |
| Ribonukleaseinhibitorprotein, tungmetall og uridin-vanadatkomplekser hemmer RNAse A-aktiviteten. | En chelator (EDTA) hemmer RNase H-aktivitet. |
| Fjerning av RNA-primer i DNA-replikering | |
| RNase A brukes ikke til fjerning av RNA-primer i DNA-replikasjon. | RNase H brukes til fjerning av RNA-primer i DNA-replikasjon |
| Fjerning av DNA-mal i komplementær DNA (C-DNA) syntese | |
| RNase A brukes ikke til fjerning av RNA-mal under komplementær DNA (C-DNA) syntese. | RNase H brukes til fjerning av RNA-mal under komplementær DNA (C-DNA) syntese. |
| Fjerning av Poly-A-Tail i mRNA hybridisert til Oligo (dt) | |
| RNase A brukes ikke til å fjerne "poly-A-hale" i mRNA hybridisert til oligo (dt). | RNase H brukes til å fjerne "poly-A-hale" i mRNA hybridisert til oligo (dt) |
Sammendrag - RNASE A vs RNASE H
Ribonukleasene er nukleaseenzymer som har evnen til å spalte RNA i mindre enheter. De er to typer; endoribonukleaser og exoribonukleaser. Endoribonuklease er en endonuklease som har evnen til å nedbryte enkeltstrenget eller dobbeltstrenget RNA. Og det spalter fosfodiesterbindingen i en RNA-polynukleotidkjede. RNase A og RNase H er to endoribonukleaser. RNase A er en bukspyttkjertel-ribonuklease som spesifikt spalter uparrede cytosin- og uracilrester i 3'-enden av det enkeltstrengede RNA ved høyere saltkonsentrasjon. RNase H er et uspesifikt ribonukleaseenzym som kan nedbryte RNA i RNA-DNA-hybrid via hydrolytisk reaksjon. Dette er forskjellen mellom RNase A og RNase H.
Last ned PDF RNASE A vs RNASE H
Du kan laste ned PDF-versjonen av denne artikkelen og bruke den til frakoblede formål som angitt i en henvisning. Last ned PDF-versjon her Forskjellen mellom RNASE A og RNASE H
