Hovedforskjellen mellom base og nukleofil er at baser er hydrogenakseptorer som kan utføre nøytraliserende reaksjoner, mens nukleofiler angriper elektrofiler for å initiere noen visse organiske reaksjoner.
Syrer og baser er to viktige begreper i kjemi. Begge har motstridende egenskaper. En nukleofil er et begrep som vi bruker mer fremtredende i organisk kjemi for å beskrive reaksjonsmekanismer og hastigheter. Strukturelt er det ikke en forskjellig forskjell mellom base og nukleofil, men funksjonelt utfører de forskjellige oppgaver.