Hovedforskjellen mellom Pluripotente og induserte Pluripotente stamceller er at de pluripotente cellene er udifferensierte moderceller (fra embryoer osv.), Som har den naturlige evnen til å skille seg inn i forskjellige celletyper, mens de induserte pluripotente stamcellene er somatiske voksne celler som har blitt genetisk omprogrammert for å vise egenskaper som ligner på naturlige pluripotente stamceller.
En stamcelle er en udifferensiert celle som har den unike evnen til å utvikle seg til forskjellige eller spesialiserte celler. Videre er stamceller av tre typer, nemlig unipotente, pluripotente og multipotente. Hvis en stamcelle kan skille seg ut i én, flere og i alle celletyper, er den kjent som henholdsvis unipotent, multipotent eller pluripotent stamcelle. Blant de tre ovennevnte typene er pluripotente stamceller viktige siden de kan skille seg ut i alle celletyper. En pluripotent embryonal stamcelle kan utvikle seg til et helt menneske.
