Hovedforskjellen mellom sonikering og homogenisering er at sonikering er en celleforstyrrelsesteknikk som bruker lydenergi for å forstyrre vev og celler, mens homogenisering er en celleforstyrrelsesteknikk som hovedsakelig bruker en fysisk kraft for å bryte cellemembraner.
For å analysere biomolekyler, deres reaksjoner og annet celleinnhold, er det nødvendig å forstyrre vev for å frigjøre celler og forstyrre celler for å frigjøre innholdet. Det er forskjellige cellelyseringsteknikker. Sonikering og homogenisering er to slike teknikker. Sonikering bruker lydenergi eller ultralydbølger for å forstyrre celler mens homogenisering bruker mekanisk kraft for å forstyrre celler.