Hovedforskjellen mellom D og L glukose er at i D-glukose er tre hydroksylgrupper og en hydrogengruppe på høyre side, mens i L-glukose er de tre hydroksylgruppene og en hydrogengruppe på venstre side.
“D” og “L” bokstavsangivelse i navnene på D-glukose og L-glukose brukes til å skille de strukturelle forskjellene i glukosemolekylet. Disse to formene kalles enantiomerer fordi deres molekylære strukturer er speilbilder av hverandre. Derfor ligger nøkkelforskjellen mellom D og L glukose i strukturen. Vi kan forklare forskjellene i formene sine ved hjelp av Fisher-projeksjonsmodellen; det er en av måtene å tegne organiske molekyler på.